Územie Slovenského krasu je významné najmä výskytom niektorých druhov, ktoré sú známe len z tejto oblasti. Sú to endemické a subendemické rastliny Slovenského Krasu ako napríklad jarabina krasová, hloh domický a rumenica turnianska. Z botanického hľadiska majú najväčší význam endemické druhy, ktoré sa svojim výskytom viažu na územie Slovenského krasu.
Najväčšie zastúpenie vo flóre Slovenského krasu majú kalcifyty a xerotermné rastliny, ktoré sú schopné sa prispôsobiť nepriaznivému stavu sucha a extrémnym mrazom (eurytermia). Najčastejšie rastú na otvorených skalnatých svahoch planín. Prevládajú medzi nimi druhy kontinentálnej až mediteránnej oblasti.