Špecifickým životným prostredím pre toto územie sú podzemné priestory - jaskyne, priepasti, podzemné toky a vyvieračky. V náväznosti na špecifické vlastnosti územia Slovenského krasu sa vytvorili pestré životné podmienky aj pre vývoj živočíšstva. Sú to hlavne nižšie skupiny živočíšstva stepného, lesostepného a skalnato-stepného charakteru ako napríklad jaskynné troglobionty, pavúkovce, mäkkýše a netopiere.